Juno avrebbe dovuto originariamente essere lanciata a giugno 2009, ma la missione fu posticipata ad agosto 2011 a causa delle restrizioni di bilancio della NASA. Il gruppo di lavoro ha sfruttato la fase di pianificazione insolitamente lunga per studiare il modo di ridurre i rischi nello sviluppo del veicolo spaziale. Alla fine il lancio dalla Cape Canaveral Air Force Station avvenne il 5 agosto 2011.
Stando ai piani attuali la missione di Juno durerà meno di quella di Galileo: dovrebbe terminare a febbraio 2018.