Ciao,
la possibilità che si sia danneggiato qualche file e/o cartella c'è (e non è bassa).
Quando hai poi riavviato il pc, è per caso partito lo scandisk in automatico?
Se è così allora sicuramente qualcosa si è corrotto, ma lo scandisk potrebbe aver ripristinato i dati esattamente come erano in origine, oppure potrebbe averli recuperati parzialmente e spostati all'interno di qualche cartella nascosta (tipo FOUND.000, FOUND.001 e simili) nella root principale.
Attenzione però, se c'è stato anche un danno fisico oltre che nella struttura logica del filesystem, i files e le cartelle relative al danno potrebbero andare persi una volta avviato lo scandisk. Quindi se dovessi notare la richiesta da parte di windows di avviare lo scandisk, tu non confermare. Piuttosto usa un programma di recupero dati come R-Studio e salva tutto su un altro hdd.
Purtroppo lo scandisk di windows molto spesso va a distruggere i files e cartelle se non riesce a recuperarli per intero (questo accade molto di frequente), mentre i programmi di recupero come R-Studio effettuano un recupero analizzando il filesystem, senza però andarlo a modificare.