Una delle cose più utili che possiamo fare con un hard disk magnetico è dividerlo in partizioni. È utile ad esempio per separare il sistema operativo dai dati, tenere il page file in una partizione dedicata, aumentare l'affidabilità (un errore nel file system potrebbe bloccare una partizione ma non l'altra), o usare più di un sistema operativo - per esempio Windows su una partizione e Linux su un'altra. Windows integra uno strumento per gestire le partizioni e queste si possono creare in fase d'installazione.