Nel 1 e.c. i Salarian aprono un portale che consente ai Rachni di invadere lo Spazio della Cittadella. La guerra con questi insettoidi controllati mentalmente dalle regine Rachni va avanti per 80 anni, finché i Salarian non scoprono i Krogan.
Questa razza molto forte e bellicosa aveva combattuto una guerra nucleare sul proprio pianeta natale Tuchanka nel 1900 a.e.c.. I Salarian li manipolano e velocizzano la loro evoluzione per sfruttarli contro i Rachni.
Nel 300 e.c i Rachni sono dichiarati estinti grazie all'aiuto dei Krogan. Come ricompensa ai Korgan viene permesso di colonizzare nuovi pianeti, ma i nuovi ambienti meno ostili danno il via a un aumento esponenziale della popolazione nei successivi 400 anni.
In questo periodo nasce il ramo Specialisti Tattica e Ricognizione della Cittadella e i suoi membri sono noti come Spettri.