Troverete molte armi in Prey. Alcune, come il Boltcaster che lancia dardi di gomma, sono solamente utilizzati per distrarre. Altre però, come il Raggio-Q e lo Shotgun, potrebbero salvarvi la vita.
Ogni arma tuttavia è efficace solamente quanto i vostri potenziamenti, ecco perché è necessario sbloccare l'abilità armaiolo, che permette di accedere allo strumento di upgrade delle armi, potenziandone ad esempio il danno, la maneggevolezza e la stabilità.