Eternal Darkness mette il giocatore nei panni di Alexandra Roivas, che scopre un misterioso libro. Il tomo è una porta che trascina la protagonista in orrori avvenuti nell'Antica Roma, nella Francia medievale, nell'Italia rinascimentale e in altri momenti storici. Nel gioco c'è un misuratore di sanità mentale che ogni tanto gioca dei brutti scherzi, come fingere che il gioco vada in crash e che i file di salvataggio siano stati cancellati.