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Il corpo centrale di Juno (pannelli solari esclusi) ha un'altezza di 3,5 metri e un diametro di 3,5 metri. È a forma esagonale e presenta una struttura a due livelli. Al decollo aveva una massa pari a 3.625 Kg ed era alloggiato a bordo di un razzo Atlas V-551.
Gli strumenti scientifici di cui vi abbiamo parlato ieri sono quasi tutti montati all'interno e attorno al corpo centrale. Come avvenne per la sonda spaziale Pioneer, Juno è un veicolo con stabilizzazione per rotazione. Il tasso di rotazione varia da 1 a 5 RPM durante le differenti fasi della missione e questo sistema gli permette di mantenere il veicolo estremamente stabile e facile da controllare.
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