Plants vs. Zombies 2 ripropone la meccanica di gioco già vista nel primo capitolo, ma inserisce anche diverse variazioni sul tema. L'ambientazione dei livelli per esempio propone diverse epoche storiche, ognuna delle quali contiene sfide diverse. Come il primo gioco, anche questo è un "tower defense", e aggiunge nuove piante e nuovi mini giochi per rendere il gameplay più variegato. EA inoltre continua ad aggiornare il gioco con nuovi contenuti.