Deus Ex 3 è il primo progetto che vedrà il lavoro congiunto tra Eidos e Square Enix, dopo l'acquisizione della software house giapponese dell'azienda britannica padre di Tomb Raider e molti altri titoli.
Square Enix, come confermato da Stephane D'Astous di Eidos Montreal, si occuperà delle sequenze di cinematica del gioco. D'Astous ha anche dichiarato che lo stesso percorso di sviluppo potrebbe essere seguito con Thief 4.
Deus Ex 3 è atteso nel corso del 2010 e lo sviluppo è stato annunciato nel 2007. Le poche indiscrezioni a oggi disponibili parlano di un motore grafico basato su una versione aggiornata di Tomb Raider Legend (ma il team di sviluppo potrebbe aver cambiato totalmente idea) e un'uscita su Xbox 360, PS3 e PC, con il PC unica piattaforma sicura. Infine, qui potete leggere alcuni dettagli sul gioco, trapelati però oltre un anno fa.