Fino ad oggi, Fallout 3 ha fatto parlare di sé soprattutto per le vicende legate ai suoi contenuti ritenuti inadatti da alcune delle società responsabili della classificazione dei videogames (un esempio su tutti è l'emblematico sistema australiano, che ha rischiato di bloccare del tutto la pubblicazione del gioco). Queste continue polemiche e restrizioni hanno spinto così i programmatori a rivedere i contenuti, come ha rivelato il Product Manager di Bethesda, Pete Hines, il quale ha inoltre confermato che sul mercato mondiale sarà lanciata la stessa identica versione per ogni singolo paese (Australia inclusa). Nessuna disparità di trattamento, quindi.
Le modifiche principali riguardano l'aspetto legato alla droga. I contenuti saranno mantenuti ma Bethesda è stata costretta a rimuovere ogni possibile riferimento a stupefacenti reali, rimpiazzando i loro nomi con delle terminologie frutto della loro immaginazione. Alcune animazioni sulla somministrazione di queste droghe, inoltre, sono state del tutto tagliate per evitare ulteriori problemi.